ある日気がついたら、システムモニターが透明化してしまった…

gnome - Transparent System Monitor Ubuntu 18.04 - Ask Ubuntu

↑ここに解決策はあった。snapで削除してaptでインストールしなおすという嘘のような本当のはなし。というかsnapで入れ直してもいいようだ。

sudo snap remove gnome-system-monitor
sudo apt install gnome-system-monitor

実は電卓もなっていたことに気づいたので、こちらも同様の手順でなおしておく。

sudo snap remove gnome-calculator
sudo snap install gnome-calculator

gnome-characters、gnome-logsは私はインストールしていなかった。